三都镇山多地少，农业经济中，经济作物种植占较大份量，并且形成了非常明显的地域特色。是全国西红花重要种植基地之一，是浙江省主要优质柑桔产地之一。

       柑桔  本镇已有100多年的栽培柑桔历史。三江口沿岸低坡丘陵土壤酸碱度适宜柑桔生产，60年代开始大面积种植。受富春江库区冬暖夏凉小气候调节，在每年桔子成熟前期三个月中，充沛的水汽条件，使柑桔果型匀称，果汁饱满，其质量可与黄岩蜜桔媲美。90年代以来，引进大浦、山川、宫本等特早熟及日本“宫内伊予柑”、“香蜜柑”、“桔橙天草”等国内外优良品种，90年代末推广应用大棚和地膜覆盖除草技术等先进栽培技术，柑桔产量和质量得到进一步提高。建立了柑桔研究所、育苗场、示范园艺场、水果技术指导站等柑桔科研、示范与推广机构和精品桔园、现代柑桔示范园、柑桔改良工程示范基地等一批科技开发应用示范基地。2005年，全镇柑桔种植面积28000多亩，占全建德市的三分之一；产量6万多吨，占全建德市的二分之一。全镇4000多农户主要依赖蜜桔销售带来的收入。

        三都镇已经成为浙江绿色农产品基地、国家级无公害柑桔基地。获得了国家质量监督检验检疫总局颁发的国家无公害农产品标志证书，连续几年获得中国（浙江）柑桔博览会金奖，在浙江省农展会和上海市农业博览会上获优质奖和金奖。

        西红花  又名藏红花、番红花，为名贵中药材。1974年本镇南华村引进西德西红花球茎试种成功，该项目为省重点科研项目。1981年黄泥山村引进日本西红花球茎试种成功。以后逐年缓慢发展，种植地域以黄泥山村到新和村一带为主。由于效益高，90年代中期以来，得到较快发展。1998年，植户面积70.1公顷，年产球茎649吨，花丝735千克，总产值1198万元，占全镇农业总产值20.9%，亩产值1.13万元。至2005年，全镇西红花面积已达147公顷，成为全国最大的西红花种植基地。2002年，在农业部进出口公司举行的西红花认证会上，建德市三都镇西红花花丝获得全国品质认证一等奖。

        镇域拥有宜渔水域面积10000多亩，发展渔业生产潜力良好。80年代末期开始发展淡水人工养殖。在富春江库区内以网箱特种养殖为主；同时在围坝形成的水域内发展珍珠蚌、河蟹及淡水鱼人工养殖。2005年人工水产养殖面积3600亩。

        三都镇是浙江省优质珍稀干果--香榧的重要产地。镇苔溪上游的前源溪、后源溪山区分布有几万株野生香榧树，部分树龄在几百年至上千年之间。大库、高丘、长潭等地有连片的古榧树群，面积数十亩。60年代，大库村从诸暨县引进品种栽种，目前成为杭州地区最大的优质香榧生产基地，因该基地位于原凤凰乡境内，出产香榧被称为“凤凰香榧”；所产香榧以壳薄、肉满、味美、香脆而闻名遐迩。90年代开始本镇规模化发展香榧基地，至2005年底，新种植香榧13000多亩。2002年成立了建德市凤凰香榧专业合作社，有会员180多名，带动农户800多户，香榧生产区域面积12000多亩，核心基地面积4000多亩。同年原凤凰乡被命名为浙江省“香榧之乡”。